北京大学出版社前身为1902年设立的京师大学堂译书局和编书处，著名翻译家、思想家严复担任译书局总办。1917年成立出版部。曾出版了当时一批著名学者编写的教材和学术专著。1952年，北大出版部撤消。1979年，教育部批准成立北京大学出版社，恢复了北大出版社建制。

恢复建制以来，北京大学出版社作为大学出版社，坚持为教学科研服务，优先安排出版大学教材和学术著作。出版图书学科覆盖广，教材专著比例大。这些各类教材及教学参考书，不仅基本上满足了北京大学教学科研的需要，还大量为其他大学广泛采用。半数以上的专著涉及新兴学科或前沿研究课题，有力地推动了科研的发展和本校师资队伍的建设。

北大出版社坚持社会效益第一，为国家服务的原则，出版了一批对党和国家的重大战略决策起重要参考作用的高水平的学术著作；坚持面向大教育、面向大科技和面向经济建设的组稿原则，不断推出高水平的学术著作和前沿、边缘学科著作。

北大出版社强调学术创新和文化积累，注重出版物内容的高质量，尤其注重组织高水准的原创性、开拓性著作。该社还积极对外开放，与世界一流出版社开展了广泛的版权贸易合作。截止到1999年底，对外转让和引进版权双双超过400种，是向外转让版权最多的出版社。

北京大学医学出版社成立于1989年8月，是中央级专业出版社，也是教育部直属的重点大学出版社。前身为北京医科大学、中国协和医科大学联合出版社，1999年3月独立建社，更名为北京医科大学出版社，2002年8月经新闻出版总署批准，更名为北京大学医学出版社。出版者前缀为ISBN-7-81071。

打造医学图书精品，服务人民健康事业。建社14年来，我社始终坚持为社会主义服务，为人民健康服务，为医学教育、科研和医疗卫生服务的办社宗旨，坚持社会效益第一的原则，共出版医学图书1400余种，发行1600余万册。以“高质量、高品位、高水平、多层次”的品牌理念，成为社会信誉度很高的大学出版社，赢得了作者、读者以及出版界业内的认可。1995年被国家教育部评为“先进高校出版社”；1995、1997、1999年连续三次被国家新闻出版署评为“全国良好出版社”；1996、1997、1998年连续三次被国家卫生部评为“杰出科技著作突出贡献出版社”。近70余种图书获部、委以上奖，其中《血管生物学》获第十一届中国图书奖，初步实现了社会效益和经济效益的最佳结合。

近年来从最初的小社发展成为初具规模和效益的中型出版社。目前，我社正在进行第二次创业，力图把我社建设成为全国重要的医药卫生类教材出版基地和重要的医学专著、译著出版基地。